两者没太大区别，主要还是颜色和口感上的区别。与花椒相比，麻椒颜色较浅，成熟后主要为深绿色，风干后呈棕黄色。麻椒的味道比花椒重，而且味道更好。麻椒产于贵州四川、阿坝和西藏，甘孜(俗称西藏轿子)。麻椒味道特别，颜色为绿色和黑色。花椒呈红色或紫色，带有芝麻味。它产于丘东北部的陵山区、四川等地。两种果实的区别在于：新鲜果实的颜色差异不大，花椒果皮顶部残留花柱很少，几乎都保留花柱；花椒果皮有气孔，无瘤状突起，尤其是花椒的瘤状突起。